1936年6月谭政人中国抗日红军大学第一期受训。“西安事变”爆发后，谭政以优异的学习成绩毕业于“红大”，到红军后方政治部任组织部长。1937年6月，升任后方政治部主任。

抗日战争爆发后，中央军委成立总政治部，毛泽东兼总部主任，谭政升任总政治部副主任，同时兼任八路军后方政治都主任。在这期间，谭政一方面组织领导了八路军、新四军在敌后坚持武装斗争和创建、发展、巩固抗日民主根据地的政治工作；另一方面，他又以敏锐的政治思维，运用特殊的武器一一手中的笔，坚持在抗日战争的烽火硝烟中为八路治工作的发展探险拓路，著书立说。

针对抗日战争这一民族解放战争的特点，谭政撰写了《论革命军队的政治工作》一文，他指出：八路军的宣传教育工作，要依据马克思主义的基本原理和中国共产党的现时政策，把阶级教育和民族教育统一起来。而统一战线中的策育，又是阶级教育的重要组成部分。

为了正确对待知识分子干部，谭政撰写了《八路军、新四军的干部政策》一文，文章送毛泽东审定，受到了毛泽东的称赞，刊登在《八政杂志》上。谭政在文章中指出：革命的知识分子是八路军、新四军干部中的新鲜血液，应当大量吸收，适时提拔，仇视知识分子，忌妒知识分子是错误码率的。

八年抗战期间，谭政还撰写了不少关于军队政治工作方面的论文，主要有：《敌人在华北的现行政策》、《华北已进入艰苦斗争的阶段》、《论敌军工作的目的与方针》、《敌军工作的当前任务》、《关于八路军的干部问题》、《论八路治工作的传统与作风》，等等。这些论著，不仅有力地指导了八路军、新四军政治工作的开展，丰富和发展了我军的政治工作，而且在理论和思想上进一步号召和团结了广大军民，激发了更大的战斗力。

1943年，谭政担任陕甘宁晋绥联防军副政治委员兼政治部主任。1944的年，兼任留守兵团政治部主任。期间，受党中央和毛泽东、周恩来的委托，在西北局高干会上作了《关于军队政治工作问题的报告》。这篇经毛泽东、周恩来修改、后经扩大的中央书记处会议通过的报告，陈述了我军政治工作的基本原则，总结了八路军、新四军思想建设和政治工作的基本经验，解决了我党历史经验、领导方法与工作作风上的许多问题，是八路军、新四军政治工作问题的全面总结，是继《古田会议决议》之后，我军政治工作的又一重要历史文献。中共中央曾给予高度评价。1944年4月20日中央宣传部和总政治部联合向全党和全军发出通知，要求全党干部和全军连级以上干部都应认真研读这个文件。同年10月1日，总政治部再次发出《对研究谭政同志政工报告的意见》的指示。随着“报告”精神在全军的深入贯彻，八路军、新四军的思想建设和政治工作，在抗日战争结束前夕，出现了一个崭新的局面。